การทำ IVF เป็นการคัดเลือกไข่ที่สมบูรณ์จากฝ่ายหญิงและนำอสุจิที่มีคุณภาพจำนวนหนึ่งจากฝ่ายชายมาผสมกันให้เกิดการปฏิสนธิในภาชนะภายนอก จากนั้นจึงนำไข่ที่ผสมแล้วจนเป็นตัวอ่อน นำไปใส่กลับที่โพรงมดลูกฝ่ายหญิง เพื่อให้เกิดการตั้งครรภ์ต่อไป
การทำ ICSI เป็นการคัดเลือกเอาตัวอสุจิจากฝ่ายชายที่มีความแข็งแรงที่ ภายใต้กล้องจุลทรรศน์ฉีดเข้าไปเพื่อผสมกับไข่จากฝ่ายหญิงแบบเจาะจงด้วยเข็มขนาดเล็ก (Micro Pipette) แบบ 1:1 ซึ่งพอผสมกันแล้วจะนำไปเลี้ยงต่อในเครื่องเลี้ยงตัวอ่อนที่มีน้ำยาเลี้ยงเฉพาะ จากนั้นเมื่อตัวอ่อนมีการพัฒนาไปอยู่ในระยะที่เหมาะสมแล้ว ก็จะนำไปใส่กลับในโพรงมดลูกฝ่ายหญิงเพื่อให้มีการตั้งครรภ์ต่อไป
จากคำอธิบายข้างต้น ความต่างกันของ 2 วิธีนี้ คือ การทำ ICSI เป็นการทำให้เกิดการปฏิสนธิแบบเจาะจง แต่การทำ IVF จะเป็นการปล่อยให้ผสมกันเอง ซึ่งในกลุ่มที่อสุจิจากฝ่ายชายไม่แข็งแรง การทำ ICSI จะมีโอกาสประสบความสำเร็จมากกว่า เนื่องจากเราสามารถคัดเลือกอสุจิที่แข็งแรงที่สุดมาปฏิสนธิได้